Antoine DE DARUVAR
Antoine De daruvar Professeur ()

Équipe LaBRI : Bench to Knowledge and Beyond
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Recherche

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Direction du Centre de Bioinformatique de Bordeaux (CBiB, http://cbi.labri.fr/) : structure a été reconnue en tant que plateforme opérationnelle de Bioinformatique dans le cadre des enquêtes RIO 2003 et 2006 et labélisée par le GIS IBiSA en 2008.\
Les axes de recherche développés au sein du CBiB concernent en priorité : l'intégration des données " omics ", la gestion et l'exploitation des données de métabolomique, l'analyse des réseaux métaboliques et la génomique comparative.\
Mes travaux personnels portent principalement sur l'exploration bioinformatique des relations entre mécanismes moléculaires et fonctions cellulaires. \

Extrait de publications


Susanna-Assunta Sansone, Philippe Rocca-Serra, Dawn Field, Eamonn Maguire, Chris Taylor, et al.. Toward interoperable bioscience data. Nature Genetics, Nature Publishing Group, 2012, 44 (2), pp.121-126

Hélène Ferry-Dumazet, Laurent Gil, Catherine Deborde, Annick Moing, Stéphane Bernillon, et al.. MeRy-B: a web knowledgebase for the storage, visualization, analysis and annotation of plant NMR metabolomic profiles.. BMC Plant Biology, BioMed Central, 2011, 11, pp.104

H. Ferry-Dumazet, L. Gil, C. Deborde, A. Moing, S. Bernillon, et al.. MeRy-B: a web knowledgebase for the storage, visualization, analysis and annotation of plant 1H-NMR metabolomic profiles. BMC Plant Biology, BioMed Central, 2011, 11:104, pp.10.1186/1471-2229-11-104

Jérôme Durand, Catherine Bodénès, Emilie Chancerel, Jean-Marc Frigerio, Giovanni Vendramin, et al.. A fast and cost-effective approach to develop and map EST-SSR markers: oak as a case study.. BMC Genomics, BioMed Central, 2010, 11, pp.570

David E Gloriam, Sandra Orchard, Daniela Bertinetti, Erik Björling, Erik Bongcam-Rudloff, et al.. A community standard format for the representation of protein affinity reagents.. Molecular and Cellular Proteomics, American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2010, 9 (1), pp.1-10


Responsabilité pédagogique

Responsable, jusqu'en juin 2007, de la mention bioinformatique du Master biologie-santé de l'UFR des sciences de la vie \
Responsabilité pédagogique jusqu'en 2006-2007 :\
- responsable de l'UE Informatique avancée, Base de données, Licence 3\
- responsable des UEs de Bioinformatique, 2ème école d'ingénieur (ESTBB)\
- responsable des UEs de Bioinformatique, 3ème école d'ingénieur (ESTBB)\
- responsable de l'UE "Bioinformatique Industriel", Master 2\
Service complet d'enseignement (192h) jusqu'à l'année 2007-2008, puis décharge en tant que vice-président du Conseil d'administration de l'Université bordeaux 2\

Administration

Depuis février 2008, Vice-président du Conseil d'Administration de l'Université Bordeaux 2\
Depuis décembre 2008 : coordination du comité " Démarche Qualité " du PRES Université de Bordeaux\
2003-2008 : Direction de la Plateforme Génomique Fonctionnelle Bordeaux : projet transversal de coordination des infrastructures pour l'étude du vivant, porté par l'Université Victor Segalen Bordeaux 2 et associe l'Université Bordeaux 1, le CNRS, l'INRA, l'INSERM et le CHU de Bordeaux (http://www.pgfb.u-bordeaux2.fr/). \
2006 – 2008 : coordination du réseau national des plateformes de bioinformatique.\
Depuis 2007 : coordination de la participation française au projet d'Infrastructure bioinformatique européen " ELIXIR ". \


Page mise à jour le 13/08/2010 à 10:56