Patrick MARY
Patrick Mary Ingénieur de Recherches (Université Bordeaux 1)

Équipe LaBRI : Modèles et Algorithmes pour la Bioinformatique et la Visualisation
Équipe projet commune INRIA-LaBRI : GRAVITE
Fonction administrative : Resp. Extraction HAL
Courrier électronique : patrick.maryarobaselabri.fr
Bureau : 373
Tél : +33 (0)5 40 00 35 20


Recherche

Je suis affecté en appui à la recherche à l'équipe "Modèles et Algorithmiques pour la Bioinformatique
et la Visualisation d'Informations" dans le thème "Visualisation d'informations".
L'équipe de ce thème oeuvre dans le domaine de la visualisation interactive, développant des
formalismes, des méthodes et des outils venant en appui à la fouille et à l'analyse de données
massives modélisées par des graphes.

Pour les travaux d'expérimentation et de validation, l'utilisation du logiciel Open Source Tulip est
privilégiée. Celui-ci, développé en langage C++ et initialement conçu par un membre de l'équipe, est
dédié à la visualisation de graphes et permet un développement et une intégration aisés de nouveaux
algorithmes (calcul de mesures, dessin, fragmentation de graphes...).

Depuis 2005, je suis en charge de l'évolution, de la maintenance et du support de Tulip qui compte
désormais près de 1600 utilisateurs recensés dans 70 pays. Hors LaBRI, le logiciel donne lieu à une
quarantaine d'utilisations quotidiennes.

Extrait de publications


David Auber, Romain Bourqui, Maylis Delest, Antoine Lambert, Patrick Mary, et al.. TULIP 4. [Research Report] LaBRI - Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique. 2016.

David Auber, Daniel Archambault, Romain Bourqui, Maylis Delest, Jonathan Dubois, et al.. Tulip III. Encyclopedia of Social Network Analysis and Mining, 2014, 978-1-4614-6169-2.

David Auber, Daniel Archambault, Romain Bourqui, Antoine Lambert, Morgan Mathiaut, et al.. The Tulip 3 Framework: A Scalable Software Library for Information Visualization Applications Based on Relational Data. [Research Report] RR-7860, INRIA. 2012, pp.31.

David Auber, Patrick Mary, Morgan Mathiaut, Jonathan Dubois, Antoine Lambert, et al.. Tulip: a Scalable Graph Visualization Framework. Sadok Ben Yahia and Jean-Marc Petit. Extraction et Gestion des Connaissances (EGC) 2010, Jan 2010, Hammamet, Tunisia. RNTI, RNTI E-19, pp.623-624, 2010, Extraction et Gestion des connaissances EGC'2010.

David Auber, Yves Chiricota, Maylis Delest, Guy Melançon, Jean-Philippe Domenger, et al.. Visualisation de graphes avec Tulip : exploration interactive de grandes masses de données en appui à la fouille de données et à l'extraction de connaissances. Monique Noirhomme-Fraiture, Gilles Venturini. EGC'07: Extraction et Gestion de Connaissances, Namur, Belgique, France. Cépaduès, pp.147-156, 2007.


Responsabilité pédagogique

2006-2014: enseignant vacataire "Stage C++", Master 2, semestre 1, 16h Eq TD

Administration

Je suis responsable de l'outil d'extraction des publications des membres du LaBRI enregistrées dans
HAL ainsi que de l'application de saisie de la fiche web de chacun.

Comité de programme & Comité d'organisation

Membre du comité d'organisation Eurovis 2010: 9 - 11 juin, Bordeaux (LaBRI)
Membre du comité d'organisation EGC 2012: 31 janvier - 3 février, Bordeaux (Haut-Carré)
Membre du comité d'organisation Graph Drawing 2013: 23 - 25 septembre, Bordeaux (LaBRI)

Diffusion

J'administre le site www.tulip-software.org (4000 visites/mois).

Page mise à jour le 13/08/2010 à 10:56