Romain BOURQUI
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bourqui[at]labri.fr
LaBRI, Université de Bordeaux
UMR CNRS 5800
351, cours de la Libération
F-33405 Talence cedex
France
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Offre de sujets de stage

Cette page présente une liste est non exhausitve des sujets de stages de je propose. Pour tout renseignement, n'hésitez pas à me contacter.
[Master] Représentation et Exploration interactive de réseaux métaboliques
Résumé: Le réseau métabolique d'un organisme représente l'ensemble des réactions biochimiques ayant lieu dans ses cellules. Ces réseaux sont généralement décomposés en voies métaboliques, c'est à dire, en sous ensembles de réactions permettant la réalisation de fonctions biologiques particulières. D'autre part, les techniques actuelles d'acquisition permettent de situer les compartiments de la cellule dans lesquelles chaque réaction a lieu. Considérant ces données, la visualisation d'information a pour objectif de fournir une représentation fidèle permettant aux experts (bioinformaticiens et biologistes) de construire puis de valider de nouvelles hypothèses. A l'heure actuelle, peu de systèmes permettent une exploration efficace de ces réseaux dû au fossé séparant le domaine de la bioinformatique et celui de la visualisation d'information. Dans ce stage, nous tenterons de combler ce fossé en prenant en compte les besoins et les contraintes liés au domaine d'application (conventions de dessin biologiques, décomposition du réseau en voies métaboliques, etc...) en fournissant des représentations pertinentes mais aussi des interactions dédiées à leur exploration.
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[Master] Discrétisation du plan pour la visualisation d'information
Résumé: L'objectif de ce stage est d'analyser ainsi que d'implémenter des opérateurs de modifications de discrétisation du plan. Ces opérateurs permettront de construire des discrétisation plus ou moins précises (sur échantillonnage ou sous échantillonnage) d'un espace en deux dimensions. Ces opérations seront appliquées pour améliorer les techniques de routage d'arêtes en faisceaux mises en place dans le thème de visualisation d'information du LaBRI (Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique).
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