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masters_project_m1 [2017/01/14 12:41] (current)
melancon created
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 +====== Projet de Master (stage-s- optionnel M1) ======
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 +===== Mai/​Juin/​Juillet 2017 =====
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 +  * Responsable:​ Guy Melançon
 +  * Equipe: Méthodes et Algorithmes pour la Bio-Informatique et la Visualisation
 +  * Mail: Guy.Melancon@u-bordeaux.fr
 +  * Durée du (des) stage(s): modulable, contactez-moi
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 +==== Application web pour la construction et modélisation de réseaux en sciences sociales ====
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 +=== Contexte et objectifs ===
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 +Notre équipe travaille à l’analyse et à la cartographie de réseaux, sociaux, criminels, historiques,​ biologiques,​ etc. Ces réseaux sont obtenus de partenaires (des entreprises,​ ou d’autres équipes scientifiques) -- des historiens, des criminologues,​ des biologistes,​ des activistes, etc.
 +
 +Les données donnent souvent une lecture imparfaite du phénomène qui est étudié.
 +
 +  * Les données pour construire un réseau criminel sont relevées des documents constitué lors d'​enquête criminelle (audition, transcription téléphonique,​ etc.). Les données apporte donc une vision du réseau correspondant à celle des enquêteurs,​ qui est par définition biaisés puisqu’ils concentrent souvent leurs efforts sur les personnes qu’ils sont susceptibles de faire condamner. ​
 +  * Les historiens sollicitent des documents lorsqu’ils commentent un fait (de la construction de l’Europe dans notre cas), et ils sont intéressés à voir s’ils introduisent un biais (en sollicitant majoritairement des références des mouvements politiques de droite, par exemple).
 +  * Les biologistes (ceux avec qui nous collaborons) travaillent à la reconstruction de réseau du métabolisme sollicité ors de l'​absorption de toxines. Les voies du réseau métaboliques sont "​devinées"​ à partir de mesures de spectrométrie de masses (mesure des masses des molécules en présence, sans savoir //a priori// quelles sont les molécules). On peut suspecter que nombre d'​informations y manquent parce que les mesures ne permettent pas de les inférer; à l'​inverse,​ on peut penser que certaines interactions dans le réseau doivent être mises en doute.
 +
 +---
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 +Le stage vise à reprendre du code existant permettant à la fois de saisir de nouvelles informations renseignant un réseau:
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 +  * Créer un nouvel acteur (une personne, un évènement,​ une molécule, etc.)
 +  * Ajouter ou corriger des informations concernant un acteur
 +  * Créer un lien entre deux acteurs
 +  * Ajouter ou corriger des informations concernant un lien entre acteurs
 +  * Supprimer un acteur et ses liens incidents
 +  * Fusionner deux acteurs
 +  * Etc.
 +
 +L'​application,​ d'​abord développée à l'aide d'une base de données relationnelle (MySQL) et de pages ''​php'',​ est en voie de migration vers une base de données de graphe Neo4j et de scripts ''​python''/''​js''​ où échange serveurs et clients. La vue tabulaire imposée par la base de données relationnelle (elle-même imposée par les spécifications initiales), laisse place à une vue graphique du réseau depuis laquelle se fait la //saisie//, la //​modélisation//​ **et** l'//​analyse//​.
 +
 +== Travail attendu ==
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 +Sur la base de l'​application dans sa version "​relationnelle",​ et à l'aide de code écrit ces derniers mois: ''​node.js'',​ ''​flask''​ (''​python''​),​ ''​tulip'',​ etc.les fonctionnalités déjà développées.
 +
 +Le développement de cette application se fait dans le contexte de plusieurs projets conduits par l'​équipe. Vous serez amené à travailler en équipe, avec les membres du laboratoire,​ mais aussi avec d'​autres stagiaires affairés à d'​autres aspects de nos projets.
  
masters_project_m1.txt · Last modified: 2017/01/14 12:41 by melancon
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