Evènement pour le groupe Combinatoire Énumérative et Algébrique


Date 2011-04-08  10:45-11:45
TitreMéthodes combinatoires de reconstruction de réseaux phylogénétiques  
RésuméLes réseaux phylogénétiques généralisent le modèle de l'arbre pour décrire l'évolution, en permettant à des arêtes entre les branches de l'arbre d'exprimer des transferts de matériel génétique entre espèces coexistantes. De nombreuses approches combinatoires ont été conçues pour reconstruire ces réseaux à partir de données extraites de plusieurs arbres de gènes contradictoires. Elles se divisent en plusieurs catégories selon le type de données en entrées (triplets, quadruplets, clades ou bipartitions) et les restrictions de structure sur les réseaux reconstruits. Je présenterai deux approches combinatoires de reconstruction de réseaux phylogénétiques, à partir de clades ou de quadruplets, ainsi que des propriétés de structure des réseaux qu'elles reconstruisent. Je montrerai également des limites de de ces méthodes, et la façon de les prendre en compte, en particulier par des pré-traitements appropriés des données.  
Lieusalle 76 
OrateurPhilippe Gambette  



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