{"id":40843,"date":"2023-04-26T09:52:24","date_gmt":"2023-04-26T09:52:24","guid":{"rendered":"https:\/\/www.labri.fr\/perso\/barla\/blog\/?p=40843"},"modified":"2023-04-26T09:53:26","modified_gmt":"2023-04-26T09:53:26","slug":"photomorphogenesis-w-didier-ela","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.labri.fr\/perso\/barla\/blog\/?p=40843","title":{"rendered":"Photomorphogenesis w\/ Didier &#038; Ela"},"content":{"rendered":"<p id=\"top\" \/>\n<p>On peut voir la photo-morphog\u00e9n\u00e8se d&#8217;une plante comme un processus qui int\u00e8gre des informations lumineuses la journ\u00e9e, entra\u00eenant un contr\u00f4le morphog\u00e9n\u00e9tique la nuit. Ce processus pourrait donc \u00eatre mod\u00e9lis\u00e9 comme une <strong>syst\u00e8me dynamique<\/strong> au tour par tour, rythm\u00e9 par les alternances jour\/nuit. Il faudrait aussi int\u00e9grer les informations autres que lumineuses, qui elles interviennent potentiellement sur d&#8217;autres plages temporelles&#8230;<br><br>Afin de comprendre un tel syst\u00e8me, il va falloir d\u00e9terminer les <strong>propri\u00e9t\u00e9s d&#8217;int\u00e9gration<\/strong> de l&#8217;information lumineuse, dans diff\u00e9rentes dimensions. <\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li>Dans la dimension spectrale, conna\u00eet-on pr\u00e9cis\u00e9ment les courbes de sensitivit\u00e9 des divers types de phytochromes ?<\/li>\n\n\n\n<li>Dans la dimension temporelle, sait-on si l&#8217;int\u00e9gration se fait de mani\u00e8re uniforme, ou biais\u00e9e en fonction de l&#8217;heure, voire de la saison (e.g., course du soleil) ?<\/li>\n\n\n\n<li>Dans dimension angulaire, conna\u00eet-on la directionnalit\u00e9 des fonctions d&#8217;absorption des phytom\u00e8res, potentiellement influenc\u00e9s par des proc\u00e9d\u00e9s de focalisation ?<\/li>\n\n\n\n<li>Dans la dimension spatiale, a-t-on une id\u00e9e de l&#8217;influence de la position, de la taille et de l&#8217;orientation globale des phytom\u00e8res le long de la plante ?<\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n<p><\/p>\n\n\n\n<p>Un \u00e9l\u00e9ment important \u00e0 prendre en compte est la probable <strong>robustesse<\/strong> de la photo-morphog\u00e9n\u00e8se aux variations de l&#8217;environnement. Pourrait-on d\u00e9j\u00e0 tenter de mesurer cette robustesse <em>in vivo<\/em>, afin de mieux comprendre par exemple les impacts du vent, de la pluie, des nuages ? Cela pourrait donner des indications sur la nature des propri\u00e9t\u00e9s d&#8217;int\u00e9gration, en particulier dans les dimensions temporelle et spatiale&#8230; On peut anticiper le besoin d&#8217;un compromis entre robustesse et directionnalit\u00e9. Je propose d&#8217;explorer une approche par <strong>populations de filtres<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n<p>Enfin, il va falloir concr\u00e8tement d\u00e9cider sur quel plan confronter exp\u00e9rimentations <em>in vivo<\/em> et simulations <em>in silico.<\/em> On pourrait tenter d&#8217;utiliser l&#8217;approche <em>in silico <\/em>pour faire des <strong>pr\u00e9dictions <\/strong>sur des mesures <em>in vivo <\/em>selon <strong>diverses hypoth\u00e8ses<\/strong>, notamment concernant les propri\u00e9t\u00e9s d&#8217;int\u00e9gration. Il faudra aussi tenir compte autant que possible des seuils de d\u00e9clenchement impliqu\u00e9s dans la photo-morphog\u00e9n\u00e8se, et potentiellement diff\u00e9rents selon les phytom\u00e8res.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>On peut voir la photo-morphog\u00e9n\u00e8se d&#8217;une plante comme un processus qui int\u00e8gre des informations lumineuses la journ\u00e9e, entra\u00eenant un contr\u00f4le morphog\u00e9n\u00e9tique la nuit. Ce processus pourrait donc \u00eatre mod\u00e9lis\u00e9 comme une syst\u00e8me dynamique au tour par tour, rythm\u00e9 par les alternances jour\/nuit. Il faudrait aussi int\u00e9grer les informations autres que lumineuses, qui elles interviennent potentiellement &#8230; <a title=\"Photomorphogenesis w\/ Didier &#038; Ela\" class=\"read-more\" href=\"https:\/\/www.labri.fr\/perso\/barla\/blog\/?p=40843\" aria-label=\"Read more about Photomorphogenesis w\/ Didier &#038; Ela\">Read more<\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[21],"tags":[],"class_list":["post-40843","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-discuss"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.labri.fr\/perso\/barla\/blog\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/40843","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.labri.fr\/perso\/barla\/blog\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.labri.fr\/perso\/barla\/blog\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.labri.fr\/perso\/barla\/blog\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.labri.fr\/perso\/barla\/blog\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=40843"}],"version-history":[{"count":2,"href":"https:\/\/www.labri.fr\/perso\/barla\/blog\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/40843\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":40845,"href":"https:\/\/www.labri.fr\/perso\/barla\/blog\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/40843\/revisions\/40845"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.labri.fr\/perso\/barla\/blog\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=40843"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.labri.fr\/perso\/barla\/blog\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=40843"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.labri.fr\/perso\/barla\/blog\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=40843"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}