Evènement pour le groupe BioInformatique et Visualisation


Date 2016-02-04  11:00-12:00
TitreLes mécanismes épigénétiques chez les végétaux ou la mémoire des plantes : Le cas du mûrissement des fruits de tomate 
RésuméSi le génotype peut être défini comme l’ensemble de l’information stockée dans le génome d’un individu, c’est bien l’expression de ce génome qui permet de créer un phénotype particulier. Or il est maintenant bien établi que l’expression du génome est influencée par de nombreux paramètres internes aux individus (développement) mais aussi en lien avec leur environnement. Par exemple, une larve d’abeille deviendra une reine ou une ouvrière simplement en fonction de la façon dont elle est nourrie. Cette différence de devenir n’est pas due à un changement de l’information génétique elle-même, mais à la façon dont elle a été utilisée. Ainsi, l’épigénétique a pour sujet l’étude «des changements d'activité des gènes — donc des changements de caractères — qui sont transmis au fil des divisions cellulaires ou des générations sans faire appel à des mutations de l'ADN». L’ADN est un polymère composé d’un enchaînement de nucléotides (une base azotée A, T G ou C associé à un sucre et à un phosphate). Chez les eucaryotes, une des bases azotées, la cytosine (C), peut être méthylée. La méthylation des cytosines est une des marques épigénétiques les plus importantes, impliquées dans de nombreux processus liés au fonctionnement du génome, tels que l’expression des gènes, la mobilité des éléments génétiques mobiles ou encore la recombinaison de l’ADN. Toutes les cytosines d’un génome ne sont pas méthylées et leur distribution, caractéristique d’un type cellulaire donnée, peut être influencée par l’environnement de la cellule Nous avons analysé les mécanismes responsables de la dynamique des cytosines dans le contexte du développement et du murissement des fruits de tomate. Nos travaux montrent que lorsque l’on interfère soit avec les processus de méthylation soit avec ceux permettant de déméthyler l’ADN, le développement et la maturation des fruits sont fortement altérés. Cela se traduit par un changement de forme, de couleur ou encore de la composition en métabolites des fruits et s’accompagne d’un changement profond du fonctionnement du génome. Nous avons démontré que le changement de fonctionnement de certains gènes ciblés est strictement corrélé à une redistribution locale des cytosines méthylées. Nous avons maintenant pour objectif d’étudier à l’échelle du génome de tomate entier, la redistribution globale des cytosines méthylées afin d’établir les liens existant entre changement de phénotype des fruits, expression des gènes et redistribution des cytosines méthylées. Enfin nous avons initié des études similaires chez d’autres types de fruits (ex : la baie de raisin) afin d’évaluer si les mécanismes identifiées chez la tomate ont une importance plus générale. 
Lieu178 
OrateurPhilippe Gallusci 
Emailphilippe.gallusci@bordeaux.inra.fr 
UrlINRA Bordeaux 



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