L'équipe Algorithmique-Combinatoire du Laboratoire LE2I à Dijon propose pour la rentrée 2008/2009 un sujet de thèse financée dans sa thématique de recherche : Étude d'objets combinatoires de grande taille - applications à la bio-informatique Localisation : LE2I à Dijon. Encadreurs : Pr. Vincent Vajnovszki, Hdr Olivier Togni, Mc. Jean-Luc Baril Résumé du sujet de thèse : Le contexte de la thèse se situe à la fois dans les domaines de la théorie des graphes et de l'algorithmique combinatoire. L'objectif est de mettre en oeuvre certaines techniques de la théorie des graphes pour l'étude des séquences de grande taille issues de différentes problèmatiques combinatoires. Plus précisemment, on s'intéressera à la pertinence des motifs récurrents dans une séquence et à la corrélation entre leur distribution et des éventuelles anomalies. Cette approche rejoint certains travaux récents réalisés à l'Université de Marne-La-Vallée concernant l'énumération et la caractérisation des ensembles de motifs inévitables dans les séquences de grande taille ou à la caracterisation des permutations induites par l'ordre lexicographique des suffixes d'un mot de Lyndon et leur generation exhaustive. De nombreuses applications sont attendues dans le domaine de la bio-informatique et plus particulièrement dans l'étude des séquences liées au génome. Les candidats doivent nous envoyer un CV avant le 7 mai 2008. L'appel à candidature est affiché sur la page http://www.u-bourgogne.fr/upload/site_183/vajnovszki.pdf Cordialement, Professeur Vincent Vajnovszki Université de Bourgogne Faculté des Sciences et Techniques LE2I, UMR-CNRS 5158 BP. 47 870, 21078 Dijon Cedex tél. 03 80 39 64 88 e-mail: vvajnov@u-bourgogne.fr Jean Luc Baril, Université de Bourgogne Faculté des Sciences et Techniques LE2I, UMR-CNRS 5158 BP. 47 870, 21078 Dijon Cedex tél. 03 80 39 38 01 e-mail: barjl@u-bourgogne.fr