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Isabelle Dutour
Recherche
Thèmes de recherche
- Bio-informatique (depuis 1999)
- Représentation et intégration de données hétérogènes issues de la biologie moléculaire
- ARN - Réseaux d'interactions - Réseaux métaboliques
- Biologie synthétique
- Combinatoire et Algorithmique (1992-2001)
- Combinatoire énumérative et bijective - Génération aléatoire - Algorithmique et Calcul formel
Projets (actuels ou récents)
- Projet MYCO-RNA - PEPS CNRS/IdEx Bordeaux, 2013 :
Développements bioinformatiques pour la prédiction d'ARN non codant et de leurs cibles en exploitant des données génomiques de plusieurs génomes de mycoplasmes.
Validation expérimentale par des approches de biologie synthétique.
- Projet national BlastSets - ACI IMPBio 2003-2007 :
Méthode et outil pour l'intégration et l'exploitation des données de Génomique Fonctionnelle
- Projet européen ACE - Réseau européen 2001-2005 :
Algebraic Combinatorics in Europe
Encadrements
- Thèses
-
Développement de méthodes bioinformatiques dédiées à la prédiction et l'analyse des réseaux métaboliques et des ARN non-codants
Amine Ghozlane (thèse soutenue en novembre 2012, co-encadrée avec Patricia Thébault et Maylis Delest)
-
Intégration des connaissances biologiques à l'échelle de la cellule
Roland Barriot (thèse soutenue en décembre 2005, co-encadrée avec David Sherman)
- Stages DEA ou master
- Une nouvelle méthode de clustering appliquée à un projet bio-informatique - Alexis Lamiable (2004, co-encadré avec Roland barriot)
- Protéomique et spectrométrie de masse - Vincent Maston (2001, co-encadré avec David Sherman)
Participation à des jurys de thèse
- En tant que rapporteur
- Gestion, Analyse et Intégration des Données Transcriptomiques -
Antony Le Béchec -- Rennes, juin 2007
- En tant qu'examinateur
- Exploration bioinformatique des relations entre mécanismes moléculaires et fonctions cellulaires -
Claire Gaugain -- Bordeaux, décembre 2007
Publications
Liste de publications